AS9100D 作为一项国际性的航空航天质量标准，并非 ISO 标准体系的组成部分。因此，任何希望符合 AS9100 标准的企业，必须在已获得 ISO 9000 认证的基础上，额外取得一份证明其质量管理体系满足 AS9100 要求的文件。例如，波音公司明确表示：“我们要求企业遵守 ISO 9001 标准，并以新版 AS9100 作为补充(Boeing's official stance is that we will require adherence to ISO 9001, supplemented by the new AS9100)”。

随着 AS9100 成为全球公认的航空航天领域国际质量标准，第三方认证已成为必然趋势。早在 1999 年，美国汽车工程师学会(SAE)就发布了程序文件 AIR 5359(《AS9000 或 AS9100 质量体系注册要求》)，该文件经航空航天质量小组(AAQG)成员、航空航天企业及相关供应商，以及认证机构(如美国注册审核员协会 RAB 等)共同认可;并于 2003 年 7 月推出 AIR 5359B 版本，作为 AS9100 新版体系的验证程序。

AIR 5359 系列程序文件对质量体系审核的执行方式作出了明确规定，具体包括：

验证机构对质量体系的评估方法;

确定评估内容与时间安排的原则;

评估中不符合项的报告及管控方式;

合格注册的建议格式;

后续评估的周期设定;

验证机构聘用航空航天领域审核员时的最低资格与经验要求;

验证机构、认证机构及 AAQG 对航空航天领域审核员的认可方式及条件。

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